在应对行政机关内部的不当行为和权力滥用问题时，行政自制理论可以发挥重要作用。行政自制理论认为，行政机关应当在自身内部建立一套有效的监督机制，通过内部制衡和自我约束，防止不当行为和权力滥用的发生。具体操作上可以采取以下措施：
建立健全的内部监督机制：包括设立审查委员会、监察部门等机构，负责监督行政机关内部的工作，及时发现和纠正不当行为。
强化内部规章制度建设：建立健全的内部规章制度，明确权责边界，规范行政行为，防止权力滥用。
加强人员管理和培训：选拔任用具有专业素养和职业道德的人员，加强对员工的培训和教育，提高他们的法制意识和职业道德水平。
开展内部监督和评估：定期对行政机关内部的工作进行评估，发现问题及时整改，并对绩效进行考核，激励遵纪守法的行为。
推行信息公开和问责制度：建立信息公开制度，增加行政机关的透明度，同时建立健全的问责机制，对不当行为和权力滥用者进行追责。
总之，行政自制理论提倡通过内部监督、规章制度、人员管理、内部监督评估和信息公开问责等多种手段来应对不当行为和权力滥用问题，从而提高行政机关的自律性和廉洁性，确保行政机关依法行政，为公众利益服务。